Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNTAP49354 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNTAP49354 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNTAP49354 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTAP49354 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTAP49354 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTAP49354 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms