Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PIK3CBP42338 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms