Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNFP41002 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNFP41002 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNFP41002 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNFP41002 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNFP41002 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNFP41002 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNFP41002 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNFP41002 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNFP41002 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNFP41002 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNFP41002 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNFP41002 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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