Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFI27P40305 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFI27P40305 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFI27P40305 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFI27P40305 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFI27P40305 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFI27P40305 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFI27P40305 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI27P40305 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms