Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRIP30626 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRIP30626 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRIP30626 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRIP30626 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRIP30626 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRIP30626 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRIP30626 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRIP30626 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRIP30626 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRIP30626 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRIP30626 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRIP30626 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRIP30626 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRIP30626 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRIP30626 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms