Protein–RNA interactions for Protein: P30305

CDC25B, M-phase inducer phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25BP30305 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25BP30305 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25BP30305 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms