Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERPINB3P29508 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms