Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF8P28908 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF8P28908 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms