Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCAP28676 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCAP28676 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCAP28676 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCAP28676 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCAP28676 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCAP28676 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCAP28676 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCAP28676 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCAP28676 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCAP28676 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCAP28676 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCAP28676 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCAP28676 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCAP28676 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCAP28676 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCAP28676 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCAP28676 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms