Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms