Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB1P20700 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LMNB1P20700 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB1P20700 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms