Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B1P20020 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms