Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN1P12814 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN1P12814 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms