Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK4P11802 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK4P11802 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK4P11802 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK4P11802 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK4P11802 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK4P11802 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms