Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAA2P0DJI9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAA2P0DJI9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms