Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBBP0CG47 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms