Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms