Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MGPP08493 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MGPP08493 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MGPP08493 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MGPP08493 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MGPP08493 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms