Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APODP05090 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APODP05090 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APODP05090 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APODP05090 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APODP05090 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APODP05090 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APODP05090 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APODP05090 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APODP05090 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APODP05090 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APODP05090 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APODP05090 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APODP05090 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APODP05090 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms