Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOA1P02647 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOA1P02647 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOA1P02647 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOA1P02647 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOA1P02647 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOA1P02647 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOA1P02647 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOA1P02647 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOA1P02647 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms