Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DQB1P01920 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DQB1P01920 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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