Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4FO95754 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4FO95754 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4FO95754 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4FO95754 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4FO95754 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4FO95754 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms