Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC2O95714 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC2O95714 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC2O95714 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC2O95714 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms