Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms