Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms