Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH4O75427 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms