Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA2O75334 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPFIA2O75334 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms