Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B1O43520 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms