Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN3O15232 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN3O15232 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN3O15232 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN3O15232 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN3O15232 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN3O15232 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN3O15232 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms