Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CDO00329 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms