Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F8VRH5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F8VRH5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F8VRH5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F8VRH5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8VRH5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8VRH5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8VRH5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F8VRH5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms