Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01546A6NGU7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms