Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC160A6NGH7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms