Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms