Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CD1E-208ENST00000368163 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AL359918.1-201ENST00000451892 2720 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CLIP4-203ENST00000401617 2162 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 KRT38-201ENST00000246646 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CD300LF-202ENST00000326165 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AL021877.1-201ENST00000457251 2194 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AL935212.2-201ENST00000419207 718 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 MRO-205ENST00000436348 1125 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 C12orf80-202ENST00000551894 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 SLC22A8-205ENST00000535878 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AC092295.2-201ENST00000592087 1392 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CD83-202ENST00000612003 2307 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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PTPRJQ12913 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AC211485.1-201ENST00000417100 1107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 LINC01135-201ENST00000419531 996 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 ACTG1P12-201ENST00000423183 1166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRJQ12913 MRPS27-212ENST00000522095 504 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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