Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 NDUFAF5-206ENST00000475968 933 ntTSL 514.96□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 414.93□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FCHO1-224ENST00000598086 554 ntTSL 414.9□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FCHO1-227ENST00000598960 534 ntTSL 414.9□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 TXNDC17-204ENST00000571957 392 ntTSL 214.89□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 CSNK1D-209ENST00000578904 1269 ntTSL 314.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 POR-211ENST00000439963 625 ntTSL 414.84□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FCHO1-202ENST00000593385 573 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 FCHO1-225ENST00000598539 551 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 RNF170-203ENST00000319104 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 DIP2A-211ENST00000481883 3119 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 44.6
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SF3B1O75533 CNOT10-207ENST00000455381 770 ntTSL 511.54□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FXR1-222ENST00000498658 683 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 411.37□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 GAK-210ENST00000507991 328 ntTSL 511.34□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-250ENST00000556008 1051 ntTSL 511.34□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FHOD1-205ENST00000567509 563 ntTSL 411.33□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDUFAF5-202ENST00000378106 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 CNIH3-204ENST00000471578 876 ntTSL 511.14□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 HDLBP-221ENST00000444092 598 ntTSL 211.12□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 GALNT7-206ENST00000512285 1567 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 211.02□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 TPM4-207ENST00000588032 712 ntTSL 311.02□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 BRD8-219ENST00000472478 745 ntTSL 311.01□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 TMEM94-226ENST00000582843 570 ntTSL 410.94□□□□□ -0.662e-11■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 RUFY2-213ENST00000602465 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 AC004381.2-201ENST00000637768 1329 ntBASIC10.63□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 AKAP10-202ENST00000395536 1815 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-267ENST00000557264 593 ntTSL 410.57□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 44.6
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