Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF1Q9Y548 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms