Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED7Q9Y3B3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMED7Q9Y3B3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms