Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM50BQ9Y247 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms