Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC2Q9Y235 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC2Q9Y235 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms