Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
L1RE1Q9UN81 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
L1RE1Q9UN81 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms