Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX12Q9UMY4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX12Q9UMY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms