Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRID1Q9ULK0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRID1Q9ULK0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms