Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PADI1Q9ULC6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PADI1Q9ULC6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms