Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms