Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIMS3Q9UJD0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms