Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMPXQ9UHP9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms