Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TCF20Q9UGU0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF20Q9UGU0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms