Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSKIPQ9P0R6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSKIPQ9P0R6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms