Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC15Q9P013 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms